每次防疫及换用不同厂家、不同批次疫苗时，最好进行少量试验，观察1d，无异常后在进行全面防疫。防疫应避开炎热和严寒时段，冬季在中午、夏季在早晚时段防疫。注苗时应备好肾上腺素等应急药物及专用注射器具，以备急救。大量免疫时甚至在注射前备好已抽取肾上腺素的注射器，以缩短抢救时间针头大小、长短要适中，针头不能太粗，以免拔出后疫苗流出，一般冻干苗用7号针头，油苗用12号针头，保证注射深度。注射部位要准确，肌肉注射一般选耳后颈部，牛羊选择颈部上缘下1/3处，猪选耳后颈部或臂部，进针方向需垂直皮肤。免疫时处置得当，减少意外噪音，减少保定，防止畜禽惊吓、操作引起的刺激。
注射器排气时溢出的疫苗，应吸附在酒精棉球上，不可随意抛洒。2）使用过的酒精棉球和未用完的疫苗和疫苗空瓶应进行严格无害化处理。注苗后，尤其在注苗30min内，应注意畜禽的反应，做到早发现、早抢救、早处理。2）防疫后会有一段时间的应答期，在防疫后加强饲养管理，应尽量减少畜禽的应激，不改变饲料品质，防止饥渴、寒冷、过热、拥挤等不良因素的刺激。不使用消毒药、抗生素、抗病毒药，否则会丧失疫苗的效力。详细记录防疫时间、畜禽类别、日龄、性别、数量、疫苗名称、厂家、批号、用量等防疫操作过程和防疫反应情况，以及积累经验、教训，更好地指导今后的动物防疫工作。
由于疫苗质量、操作方法不当或畜禽个体体质差异，以及气候温度等多种原因，若出现注苗反应，对防疫反应做以下处理。轻度反应会出现轻度的精神萎靡不振、体温稍高、食欲减退或停食，一般不需治疗处理，最好不用任何药物，停食1～2顿以后可自行好转。若1～2顿以后不见好转可能继发其他疾病，应对症治疗。中度反应可能出现急性过敏反应，气喘、呼吸加快、眼结膜充血、发抖、皮肤发紫、口吐白沫、不时排粪，后肢不稳或倒地抽搐，若不及时治疗处理可能造成死亡。治疗方法：尽快皮下注射0.1%盐酸肾上腺素，牛用5mL，猪、羊用1mL。对未怀孕的病畜肌肉注射地塞米松磷酸钠，牛用30mg，猪、羊用10mg，若病畜体温越过40℃，应注射解热镇痛药，若病畜心脏衰竭，皮肤发绀，可注射安钠咖，并注意保温，将其置于安静通风处，给予充足饮水。
